>>7219829 (OP)
Потому что у него есть личная мотивация, а именно стремление к абсолютной власти. Все остальное это последствия его воспитания в условиях военных действий, где и заработал себе комплекс Мессии.
Обито - другой. Его мотивация заключается в возвращение свой любимой, причём в таких условиях, где она уж точно умереть не может. Хотя для него лучше был бы путь воскрешение Рин-Активация БЫ-Жизнь с реальной Рин в манямире.
Стоит отметить, что хотя ни Мадара, ни Обито не знали о превращение жертв БЦ в зецу, все же именно это привело бы к смерти человечества в целом.
На фоне этого даже проект совершенствования человечества СИЛ менее злостный, так как там хотя бы люди из ЛСЛ выйдут позже и может даже в лучшем виде, а в БЦ все просто сдохнут.
Кстати говоря, мотивация Обито и Гендо одна и таже,да и вообще пересечений Наруто-Евангелион довольно много.