Лучше зацените какая интерпретация Сталкера после того как покурил дневники Тарковского пришла.

Сталкер - возможно довольно автобиографичная вещь. Лучше всего люди пишут, снимают итд про самих себя или про то чему были свидетелями. Или же это вообще почти всегда про себя, про "свои" состояния и то что пропустили через себя в том или ином виде.

Так же и здесь. Причина, по которой Тарковский после 9 переписанных сценариев Стругацкими остановился на том образе Сталкера, на котором остановился, в том что он увидел в нем себя.
Возможно даже бессознательно, потому что он сам не мог сформулировать этот образ АБС по воспоминаниям многих и сам не мог объяснить, что же собственно хотел. Только после того как Стругацкие сами от отчаяния перевернули образ сталкера с крутого парня на юродивого, Тарковский внезапно сказал "да, это оно".
И вот тут возникает ощущение, что Сталкер и его бегства от обыденного мира и даже семьи в Зону - это про его жизнь.

Зона - никакая не аномалия, вернее не аномалия в бытовом смысле. Зона - это зона творчества, кино, в которую он бежал от внешнего мира. В которую ещё нужно продраться через представителей власти как и в фильме (в реальности Тарковского - получить согласие и финансирование от чиновников), взять с собой тех кому это интересно и нужно (Писатель и Учёный (условный физик и лирик) - типичные зрители его картин?), по дороге ещё обходить ловушки, которые к тому же не проявляют себя никак корме образов прошлого (цензура? больше придуманная или рассказанная кем-то и существующая только в голове у Сталкера-художника в виде внутренних ограничений, а не реальных?).

Неустроенность в семье, материальная неблагополучность, трудный ребенок и ссоры с женой - все это тоже сильно перекликается с той жизнью, которую он описывает в дневниках. Несмотря на казалось бы звёздность очень частая фраза внутри них "дома ни копейки", "отдал долги таким-то".
Единственное место где ему по-настоящему хорошо - Зона, и отнять ее значит отнять возможность творить, значит конец в общем-то и всей жизни и того ценного что есть в ней для Тарковского.

Не очень понятен момент с комнатой желаний, но пересечения необязательно должны полностью объяснять весь фильм, скорее тут про работу бессознательных механизмов. Возможно Тарковский их сам до конца не понимал...
Возможно комната желаний - это и есть конечный результат творчества. Самому художнику причем оно само по себе уже не нужно, ему и так хорошо в процессе, но может быть этот результат пригодится другим, которых он туда и водит.